Weryfikacja pochodzenia u alpak

Przy zamówieniu badania pochodzenia wraz z profilem genetycznym dla potomstwa, badanie „Profil genetyczny” zostanie automatycznie dodane do zamówienia w cenie 1350 CZK. Określenie profilu genetycznego jest niezbędne do ustalenia pokrewieństwa, ponieważ relacje rodzinne określa się poprzez porównanie profili genetycznych. W ramach profilowania genetycznego Genomia analizuje markery: LCA5, LCA8, LCA19, LCA37, LCA56, LCA65, LCA66, LCA94, LCA99, LGU49, LGU50, YWLL44, YWLL29 oraz YWLL40.

Aby ocenić pokrewieństwo pomiędzy potomstwem, ojcem i matką, konieczne jest określenie profilu genetycznego wszystkich uczestniczących osobników. Wynikiem są cztery certyfikaty — trzy certyfikaty profilu genetycznego oraz jeden certyfikat potwierdzenia pochodzenia.

Weryfikacja pochodzenia odbywa się poprzez porównanie profili genetycznych potomstwa, ojca i matki. Potwierdzenie ojcostwa lub macierzyństwa nie jest jednoznaczne bez analizy całej rodziny. W celu uzyskania wysokiego prawdopodobieństwa potwierdzenia ojcostwa zaleca się dostarczenie próbek od obojga rodziców. Osobniki tego samego gatunku są genetycznie bardzo podobne i różnią się jedynie w części markerów mikrosatelitarnych.

Czy mogę dostarczyć już istniejący profil genetyczny do weryfikacji pochodzenia?

Zamiast próbki do wykonania profilu genetycznego można dostarczyć już gotowy profil genetyczny. Jeśli jeden z ocenianych profili został wykonany w innym laboratorium, Genomia pobiera opłatę 150 CZK (z VAT) za przetworzenie zewnętrznego profilu genetycznego.

Każdy zewnętrzny profil oceniany jest indywidualnie. Genomia zastrzega sobie prawo do odrzucenia zewnętrznego profilu do celów weryfikacji pochodzenia. Preferowane są profile wykonane przez laboratoria uczestniczące w testach jakości ISAG z wynikiem „rank 1”, co odpowiada skuteczności na poziomie 98–100%.

Czym jest profil genetyczny?

Profil genetyczny (profil DNA) można określić na podstawie próbki krwi. Zasada weryfikacji pochodzenia jest podobna jak u ludzi — poszukiwane są wspólne cechy genetyczne w DNA potomstwa i rodziców. Jeśli badany rodzic jest rzeczywistym rodzicem biologicznym, pokrewieństwo zostaje potwierdzone, ponieważ rodzic biologiczny dzieli z potomkiem jeden allel w każdym markerze.

Do analizy pokrewieństwa wykorzystuje się sekwencje STR (Short Tandem Repeats), zwane również mikrosatelitami. Są to markery genetyczne zbudowane z powtarzających się sekwencji DNA o długości od dwóch do siedmiu par zasad. Allele STR różnią się liczbą powtórzeń danego motywu sekwencyjnego. Dzięki wysokiemu polimorfizmowi i dziedziczeniu zgodnemu z prawami Mendla mikrosatelity są doskonałymi markerami do identyfikacji osobników, testów pochodzenia oraz badań różnorodności genetycznej.

Analiza STR wykonywana jest metodą multipleksowej reakcji PCR. Jeden z primerów każdej pary jest znakowany fluorescencyjnie na końcu 5’. Namnożone fragmenty są następnie rozdzielane i wykrywane przy użyciu automatycznego urządzenia do elektroforezy kapilarnej.

Do profilowania genetycznego i weryfikacji pochodzenia u alpak wykorzystywane są markery:
LCA5, LCA8, LCA19, LCA37, LCA56, LCA65, LCA66, LCA94, LCA99, LGU49, LGU50, YWLL44, YWLL29 oraz YWLL40.