Analiza SNP koni do badań genomowych wartości hodowlanych z wykorzystaniem technologii Illumina Equine80Select BeadChip

BeadChip zawiera łącznie 79 000 markerów wybranych na podstawie genotypowania siedmiu ras koni (Arab, Andaluzyjski, Achal-tekiński, Islandzki, Standardbred, Pełnej krwi angielskiej, Quarter horse):

• około 77 000 markerów autosomalnych
• około 2 000 markerów płciowych
• około 300 markerów mitochondrialnych
• około 1 000 markerów do testów ojcostwa i identyfikacji chorób
• normalna gęstość markerów w obszarze głównego kompleksu zgodności tkankowej koni

BeadChip nadaje się do imputacji genetycznej przy wyższej gęstości markerów oraz ma nakładanie z markerami Axiom Equine Genotyping Array. Zalecane zastosowania układu:

• Badania złożonych cech
  • Analiza różnorodności
  • Genomiczne prognozowanie ryzyka chorób
  • Weryfikacja pochodzenia
• Hodowla molekularna
  • Podstawowe badania asocjacyjne
  • Zwiększenie efektywności programów hodowlanych
  • Podstawowa analiza sygnatur selekcji

Wynikiem są dane z Illumina Equine80Select BeadChip. Raport końcowy w formacie TXT jest przeznaczony do przetwarzania w GenomeStudio.