Генетический профиль альпаки

Генетический профиль, также называемый ДНК-профилем, представляет собой набор генетических маркеров, позволяющих однозначно идентифицировать животное. Генетический маркер — это определённый участок ДНК, различающийся у разных особей. Генетический профиль остаётся неизменным на протяжении всей жизни и не может быть подделан или уничтожен. Он используется для идентификации животных, подтверждения происхождения и оптимизации разведения.

Возможности использования генетического профиля

Определение генетического профиля служит надёжным пожизненным методом идентификации в различных ситуациях:

• При потере или краже альпаки — Позволяет подтвердить личность найденного или возвращённого животного.
• При неисправности или утрате идентификации — Если микрочип перестал функционировать или была утрачена другая форма маркировки, генетический профиль позволяет надёжно подтвердить личность животного.
• При репродукции и работе с репродуктивным материалом — Используется для идентификации спермы или эмбрионов.

Также применяется для подтверждения происхождения:

• Для стандартной проверки родословных или при сомнениях в происхождении — Позволяет надёжно подтвердить отцовство или материнство.
• Для подтверждения родственных связей — Возможно подтверждение родства между братьями и сёстрами, дедушкой/бабушкой и внуками, а также других родственных отношений. Чем больше родственных животных участвует в тестировании, тем выше точность оценки вероятности родства.

В племенной работе генетический профиль используется для:

• Подбора оптимальных племенных пар — Сравнение генетических профилей позволяет подбирать комбинации животных для сохранения генетического разнообразия популяции.
• Популяционных исследований — мониторинга генетического разнообразия, гетерозиготности и инбридинга.

Отбор образцов

Для генетического тестирования предпочтительно использовать образцы крови. Отбор проводит ветеринарный врач, который одновременно подтверждает личность животного посредством проверки микрочипа или другой идентификации. Анализ очень чувствителен к качеству ДНК. Также возможно использование буккального мазка, однако образец должен быть правильно взят и храниться в воздухопроницаемой упаковке для полного высыхания.

Методика исследования

Лаборатория использует международно признанные стандарты генетической идентификации, основанные на анализе STR-маркеров (Short Tandem Repeats). ДНК-профилирование подходит для идентификации животных, подтверждения происхождения и проверки родственных связей.

Существуют два основных технологических подхода к генетическому профилированию: STR и SNP. Эти методы несовместимы между собой и не могут напрямую сравниваться.

STR-генетический профиль

STR-профиль основан на анализе микросателлитных маркеров — коротких повторяющихся последовательностей ДНК длиной от двух до семи пар оснований. Количество повторов индивидуально и наследуется от родителей, что делает STR-профили особенно подходящими для подтверждения происхождения и генетической идентификации.

Процесс STR-анализа включает несколько основных этапов:

• Выделение ДНК — ДНК извлекается из образца и служит исходным материалом для анализа.
• ПЦР-амплификация — Определённые участки ДНК, содержащие STR-маркеры, амплифицируются методом полимеразной цепной реакции.
• Разделение фрагментов методом электрофореза — Амплифицированные фрагменты ДНК разделяются по длине в электрическом поле.
• Детекция и анализ данных — Флуоресцентно меченые фрагменты ДНК регистрируются лазерным сканером.
• Интерпретация результатов — Результатом является уникальная комбинация маркеров, идентифицирующая конкретное животное.

Сравнение STR-профилей позволяет подтверждать идентичность или родственные связи с очень высокой степенью достоверности.

Список маркеров, включённых в панель

LCA5, LCA8, LCA19, LCA37, LCA56, LCA65, LCA66, LCA94, LCA99, LGU49, LGU50, YWLL44, YWLL29, YWLL40.