Определение генетического профиля собаки

Для чего нужно определять генетический профиль собаки?

Определение генетического профиля означает определить набор признаков, которые для данной особи являются характерными и незаменимыми (например, как отпечатки пальцев). По генетическому профилю особь можно однозначно идентифицировать. Генетический профиль собаки может найти применение в следующих случаях:

1) Потеря, кража

Генетический профиль собаки позволяет однозначно доказать идентичность в случае, если потерянную или украденную собаку удастся найти.

2) Идентификация на всю жизнь

В случае, если микрочип, которым снабжена собака, перестанет работать, можно доказать идентичность собаки и поставить новый чип.

3) Проверка отцовства или материнства

Генетический профиль необходим для тестирования родства особей, в частности, для проверки отцовства или материнства.

4) Осеменение

Часто требуется определение генетического профиля у племенных собак, сперма которых передается на хранение и впоследствии применяется для осеменения. Генетический профиль однозначно идентифицирует сперму и им можно воспользоваться для проверки отцовства.

5) Проверка на „clear по родителям"

У пород, которые отягощены конкретным рецессивным генетическим дефектом, обычно принято тестировать выбранную родительскую пару на отсутствие данного дефекта. Если родители здоровы, то имеется практически 100 % уверенность в том, что и потомство будет здоровым (вероятность возникновения новых мутаций составляет порядка долей процента).

Иногда новые хозяева щенков хотят убедиться в том, что выбранный щенок действительно не отягощен риском конкретного дефекта. Это может быть подтверждено прямым тестом на данный генетический дефект или подтверждением отцовства и материнства – щенок является потомком декларированных родителей, которые данный генетический дефект не имеют.

Рекомендуем при покупке щенков, в отношении которых указано «clear по родителях» или «normal по родителях», проверить отцовство и материнство. Данная мера является профилактикой махинаций или иных недобросовестных действий питомника.

6) Выбор оптимальной племенной пары

При выборе оптимальной племенной пары проводится оценка по целому ряду атрибутов – характер, внешний вид, здоровье и т.д. Генетический профиль может быть использован в качестве дополнительного инструмента, который позволит сделать правильное решение. Если мы хотим принести в племенную линию новую кровь, желательно сравнить генетические профили потенциальных родителей. Желательно, чтобы племенная пара была в максимально возможной мере гетерозиготной (различающейся) по сравниваемым признакам. Верно, что чем больше различающихся признаков имеют особи, тем меньше их генетическая похожесть.

Сравнение генетических профилей племенных особей позволяет добиться максимального генетического разнообразия в рамках породы и сохранить требуемые физические и психические свойства данной породы.

.

Что такое генетический профиль?

Определить генетический профиль означает определить набор генетических признаков, которые для данной особи характерны и незаменимы (например, отпечатки пальцев). По генетическому профилю особь можно однозначным образом идентифицировать.

Для определения генетического профиля используются короткие тандемные повторы (STR). Данные повторы, также называемые микросателлитами, представляют собой класс генетических маркеров, состоящих из тандемных повторов последовательностей размером от двух до семи пар оснований. Аллели STR локуса изменяются в зависимости от количества повторов данного мономера. Из-за высокого уровня полиморфизма (информативности) и менделеевской наследственности микросателлиты стали удобными генетическими маркерами для изучения генетического разнообразия, тестирования родства и непосредственной идентификации.

STR аллели определяются с помощью полимеразной цепной реакции (PCR-polymerase chain reaction). Один из праймеров каждой пары на 5-м конце обозначается флюоресцирующим красителем. Разделение и определение фрагментов проводится в ходе одного электрофоретического эффекта, с применением автоматического электрофоретического прибора.

С точки зрения тестирования профилей возможны два главных подхода:

маркеры по ISAG - international society of animal genetics

маркеры AKC - american kennel club

Данные два подхода ключевым образом различаются в определяемых маркерах, поэтому результаты тестирования, выполненного с применением данных двух подходов, не являются взаимно сочетаемыми. Например, если у одного из родителей генетический профиль будет определен по AKC, а у потомка по ISAG, сравнением результата нельзя определить родство. Наоборот, если у обоих генетический профиль будет определен с применением одного и того же подхода, родство можно определить путем сравнения результатов, без необходимости проведения дальнейших анализов.

Подход по ISAG более распространен в Европе, рекомендуется Международной кинологической федерацией (FCI), по данному подходу определяется больше маркеров, чем по AKC. Подход АКС больше распространен в Америке.

Лаборатория Genomia регулярно принимает участие в сравнительных тестах качества, проводимых каждые два года организацией ISAG (International Society for Animal Genetics). Ниже можно ознакомиться с последним сертификатом качества, лаборатория Genomia успешно определила 100% установленных маркеров ДНК собаки.

.

.

.

.

Лаборатория гарантирует определение как минимум 17 из следующих 22 маркеров:

AHTk211, CXX279, REN169O18, INU055, REN54P11, INRA21, AHT137, REN169D01, AHTh260, AHTk253, INU005, INU030, амелогенин, FH2848, AHT121, FH2054, REN162C04, AHTh171, REN247M23, AHTH130, REN105L03, REN64E19. Данные маркеры включены в рекомендуемый список согласно International Society for Animal Genetics (ISAG).