Определение генетического профиля - Амазоны

Для тестирования генетического профиля мы отдаем предпочтение проведению анализа по образцу крови. Анализ очень чувствителен на качество ДНК. Для анализа достаточное удаление 2 капли крови в пробирку с этанолом.

Определение генетического профиля означает определить набор признаков, которые для данной особи являются характерными и незаменимыми (например, как отпечатки пальцев). По генетическому профилю особь можно однозначно идентифицировать.

Для определения генетического профиля используются короткие тандемные повторы (STR). Данные повторы, также называемые микросателлитами, представляют собой класс генетических маркеров, состоящих из тандемных повторов последовательностей размером от двух до семи пар оснований. Аллели STR локуса изменяются в зависимости от количества повторов данного мономера. Из-за высокого уровня полиморфизма (информативности) и менделеевской наследственности микросателлиты стали удобными генетическими маркерами для изучения генетического разнообразия, тестирования родства и непосредственной идентификации.

STR аллели определяются с помощью полимеразной цепной реакции (PCR-polymerase chain reaction). Один из праймеров каждой пары на 5-м конце обозначается флюоресцирующим красителем. Разделение и определение фрагментов проводится в ходе одного электрофоретического эффекта, с применением автоматического электрофоретического прибора.

Лаборатория выполняет определение маркеров: AgGT21, AgGT12, AgGT29, AgGT72, AgGT83.

Литература:

Gebhardt KJ, Waits LP.: Cross-species amplification and optimization of microsatellite markers for use in six Neotropical parrots. Mol Ecol Resour. 2008 Jul;8(4):835-9.

Russello M. A., Calcagnotto D., DeSalle R., Amato G.: Characterization of microsatellite loci in the endangered St. Vincent Parrot, Amazona guildingii , Molecular Ecology Notes. 2001:162-164

Russello M. A., Lin, K., Amato, G., Caccone A.:, Additional microsatellite loci for the endangered St. Vincent Parrot, Amazona guildingii, Conservation Genetics, 2006, 643-645