Stanovení genetického profilu ptáků rodu Amazoňan

Pro ověření příbuznosti objednávejte k testu genetického profilu potomků test: Amazoňan - parentita ke genetickému profilu - pro mláďata

V případě testování genetického profilu preferujeme vzorky krve. Analýza je velice citlivá na kvalitu DNA. Pro analýzu postačuje odběr 2 kapek krve do zkumavky s ethanolem.

Testy DNA profilu a ověření parentity potomků jsou potřebné pro vydání stanoviska k výjimkám ze zákazu obchodních činností vědeckým orgánem CITES. Instrukce pro odběry vzorků za účelem vydání výjimky najdete zde. Vědecký orgán CITES vyžaduje testy pro odchovy následujících druhů:

• amazoňan rudoocasý (Amazona brasiliensis)
• amazoňan nádherný (Amazona pretrei)
• amazoňan rudooký (Amazona rhodocorytha)

Stanovení genetického profilu znamená určit soubor genetických znaků, které jsou pro daného jedince charakteristické a nezaměnitelné (např. jako otisk prstu). Podle genetického profilu lze jedince jednoznačně identifikovat.

Ke stanovení genetického profilu jsou využívány tandemové repetitivní sekvence (STR). Tyto sekvence, také nazývané mikrosatelity, jsou třídou genetických markerů, sestávajících se z tandemově opakovaných sekvencí o velikosti dvou až sedmi párů bází. Alely STR lokusu se odlišují podle počtu opakování daného sekvenčního motivu. Kvůli vysoké hladině polymorfizmu (informativity) a Mendelovské dědičnosti se mikrosatelity staly vhodnými genetickými markery pro studium diverzity, testování paternity a vlastní identifikace.
STR alely jsou nejčastěji zjišťovány pomocí multiplexové polymerázové řetězové reakce (PCR-polymerase chain reaction). Při PCR vzniknou fragmenty obsahující STR motivy. Tyto fragmenty jsou fluorescenčně značené, což umožňuje jejich separaci a vizualizaci s použitím automatizovaného elektroforetického přístroje.
Laboratoř Genomia stanovuje pro DNA profil Amazoňanů markery: AgGT21, AgGT12, AgGT29, AgGT72, AgGT83.

.

Reference:

Gebhardt KJ, Waits LP.: Cross-species amplification and optimization of microsatellite markers for use in six Neotropical parrots. Mol Ecol Resour. 2008 Jul;8(4):835-9.

Russello M. A., Calcagnotto D., DeSalle R., Amato G.: Characterization of microsatellite loci in the endangered St. Vincent Parrot, Amazona guildingii , Molecular Ecology Notes. 2001:162-164

Russello M. A., Lin, K., Amato, G., Caccone A.:, Additional microsatellite loci for the endangered St. Vincent Parrot, Amazona guildingii, Conservation Genetics, 2006, 643-645