Определение генетического профиля - Какаду

Для тестирования генетического профиля мы отдаем предпочтение проведению анализа по образцу крови. Анализ очень чувствителен на качество ДНК. Для анализа достаточное удаление 2 капли крови в пробирку с этанолом.

Определение генетического профиля означает определить набор признаков, которые для данной особи являются характерными и незаменимыми (например, как отпечатки пальцев). По генетическому профилю особь можно однозначно идентифицировать.

Для определения генетического профиля используются короткие тандемные повторы (STR). Данные повторы, также называемые микросателлитами, представляют собой класс генетических маркеров, состоящих из тандемных повторов последовательностей размером от двух до семи пар оснований. Аллели STR локуса изменяются в зависимости от количества повторов данного мономера. Из-за высокого уровня полиморфизма (информативности) и менделеевской наследственности микросателлиты стали удобными генетическими маркерами для изучения генетического разнообразия, тестирования родства и непосредственной идентификации.

STR аллели определяются с помощью полимеразной цепной реакции (PCR-polymerase chain reaction). Один из праймеров каждой пары на 5-м конце обозначается флюоресцирующим красителем. Разделение и определение фрагментов проводится в ходе одного электрофоретического эффекта, с применением автоматического электрофоретического прибора.

Лаборатория выполняет определение маркеров: pCIA119, pCIA139, pCIA125, pCIA105, pCID7, pCIA128, pCID109, pCI8.

Литература:

N.E. White, et al., Application of STR markers in wildlife forensic casework involving Australian black-cockatoos (Calyptorhynchus spp.), Forensic Sci. Int. Genet. (2011), doi:10.1016/j.fsigen.2011.10.003

White, N.E. , Mawson, P.R., Dawson, R., Bunce, M.A. and Spencer, P.B.S. (2009) Characterisation and cross-species utility of 20 microsatellite markers for population and forensic applications in the endangered Carnaby's Black-cockatoo, Calyptorhynchus latirostris. Conservation Genetics Resources, 1 (1). pp. 341-345