SNP-Analyse von Pferden zur Erforschung genomischer Zuchtwerte mit der Illumina Equine80Select BeadChip-Technologie

Der BeadChip enthält insgesamt 79.000 Marker, die auf Grundlage der Genotypisierung von sieben Pferderassen ausgewählt wurden (Araber, Andalusier, Achal-Tekkiner, Isländer, Standardbred, Vollblut, Quarter Horse):

• ca. 77.000 autosomale Marker
• ca. 2.000 Geschlechtsmarker
• ca. 300 mitochondriale Marker
• ca. 1.000 Marker für Vaterschaftstests und Krankheitsbestimmungen
• normale Markerdichte im Bereich des Haupthistokompatibilitätskomplexes des Pferdes

Der BeadChip eignet sich für genetische Imputation mit höherer Markerdichte und überschneidet sich mit Markern des Axiom Equine Genotyping Arrays. Geeignete Anwendungen des Arrays:

• Forschung komplexer Merkmale
  • Diversitätsanalysen
  • Genomische Krankheitsrisikoprädiktion
  • Abstammungsüberprüfung
• Molekulare Züchtung
  • Grundlegende Assoziationsstudien
  • Steigerung der Effizienz von Zuchtprogrammen
  • Grundanalysen von Selektionssignaturen

Das Ergebnis sind Datenausgaben des Illumina Equine80Select BeadChip. Der Abschlussbericht liegt im TXT-Format zur Verarbeitung in GenomeStudio vor.