
Testy pro koně: Lokus C
Lokus C
Lokus C je velmi pozoruhodným lokusem ovlivňujícím výsledné zbarvení mnoha plemen koní. V kombinaci s alelami lokusu E a lokusu A vytváří hned několik variabilních fenotypů. U koní jsou evidovány základní tři barvy – hnědák (bay), ryzák (chestnut) a vraník (black). Ostatní barvy a jejich různé variace jsou povětšinou výsledkem ředění barvy základní. Vlivem působení alel lokusu C dochází k redukci množství pigmentu a vzniku různých variant zbarvení. Celkem byly v rámci lokusu C nalezeny již 4 alely, které proměňují základní barvy v širokou škálu světlých odstínů barev.
.
1. alela C^Cr (cream dilution)
Historicky první zmapovanou alelou lokusu C je alela C^Cr (cream dilution). Detekovaná substituční mutace v exonu 2 genu MATP/SLC45A2 (g.31690653G>A) je zodpovědná za ředění základní barvy. Způsob dědičnosti je neúplně dominantní – čím více kopií alely, tím je výsledný fenotyp výraznější. V případě zdědění pouze jedné alely C^Cr dochází ke změně zbarvení na žlutou či zlatou. Ovlivněn je pouze červený pigment (feomelanin), černý pigment (eumelanin) zůstává nedotčený. V případě výsledného genotypu zahrnující dvě alely C^Cr dochází k ovlivnění obou typů pigmentu. Červený pigment je úplně zesvětlený a účinku ředění podléhá i pigment černý. Taktéž dochází i ke změně barvy očí na modrou barvu a zesvětlení kůže až na růžovou barvu. Pro přehlednost jsou výsledné typy zbarvení podléhající rozdílné míře ředění pigmentu (na základě detekovaného genotypu) uvedeny v následující tabulce.
.
|
Základní zbarvení |
Genotyp N/ C^Cr |
Genotyp C^Cr/ C^Cr |
|
ryzák (chestnut) |
izabela (palomino) |
cremello |
|
hnědák (bay) |
plavák (buckskin) |
perlino |
|
vraník (black) |
tmavý plavák (smoky black) |
smoky cream |
.
2. alela C^prl (pearl)
Druhou alelou lokusu C, která ovlivňuje ředění pigmentu základní barvy je alela C^prl (pearl). Substituční mutace se nachází v exonu 4 genu MATP/SLC45A2 (g.31709690G>A). Výsledný fenotyp je děděný autozomálně recesivně - aby došlo k projevu perlového fenotypu, musí jedinec od rodičů zdědit dvě kopie alely C^prl. Barevný projev je velmi podobný odstínům vzniklým působením alely CH (champagne) a heterozygotním genotypem alely C^Cr. Dále může působit i vliv alely G (greying). Projevy těchto zmíněných alel jsou od sebe vizuálně často prakticky k nerozlišení. Jedinou možností, jak odhalit, která z alel stojí za výsledným fenotypem je genetický test. Zvláštním úkazem jsou i složení heterozygoti alel C^Cr a C^prl (pseudo-double cream). Jedinci mají velmi světlou až růžovou barvu kůže a světlou barvu srsti. Oči bývají modré či zelené. U čistokrevných španělských koní tito jedinci nesou příhodný název krémová perla. Je pravděpodobné, že i velká část koní s označením cremello, perlino a smoky cream může nést v genotypu i alelu C^prl.
Mezi plemena, která jsou projevem alely C^prl dotčena patří: Iberský kůň, Španělský kůň, Lusitano, Quater horse a Paint horse. U plemen Paint horse a Quarter horse jsou koně s genotypem C^prl /C^prl známi pod označením ‘‘Barlink factor’‘.
Na obrázku a) je vidět, jaký barevný projev působí genotyp C^prl /C^prl při ředění z původní černé barvy. Výsledný genotyp koně je EE/Ee; Aa/Aa; Gg/Gg; C^prl /C^prl.
Na obrázku b) je ředěna původní hnědá barva a výsledný genotyp koně je EE/Ee; AA/Aa; Gg/Gg; C^cr /C^prl.
.
3. alela C^sno (snowdrop)
Třetí detekovanou alelou je alela C^sno (snowdrop). Nachází v exonu 1 genu MATP/SLC45A2 (g.31688649G>A). Způsob dědičnosti je autozomálně recesivní. Aby se ve výsledném fenotypu projevil efekt alely snowdrop, musí potomek zdědit od rodičů dvě kopie této alely (C^sno/C^sno). Mutace způsobující ředění barvy byla nalezena u plemene Traditional Gypsy Cob.
.
4. alela C^sun (sunshine) – laboratoř Genomia testování této alely nenabízí
Prozatím poslední z detekovaných alel lokusu C, která ovlivňuje ředění základní barvy, je alela C^sun. Alela byla nalezena u plemene Standardbred x Tennessee Walking Horse cross.
.
Palomino

.
Buckskin

.
Smoky black

.
Cremello

.
Perlino

.
Smoky cream

Bisbee, Danielle, et al. "Identification of a novel missense variant in SLC45A2 associated with dilute snowdrop phenotype in Gypsy horses." bioRxiv (2019): 851246.
Holl, H.M., Pflug, K.M., Yates, K.M., Hoefs-Martin, K., Shepard, C., Cook, D.G., Lafayette, C. and Brooks, S.A. (2019), A candidate gene approach identifies variants in SLC45A2 that explain dilute phenotypes, pearl and sunshine, in compound heterozygote horses. Anim Genet, 50: 271-274. https://doi.org/10.1111/age.12790
Mariat, Denis, Sead Taourit, and Gérard Guérin. "A mutation in the MATP gene causes the cream coat colour in the horse." Genetics Selection Evolution 35.1 (2003): 119-133.
Sevane, N., C. R. Sanz, and S. Dunner. "Explicit evidence for a missense mutation in exon 4 of SLC45A2 gene causing the pearl coat dilution in horses." Animal Genetics 50.3 (2019): 275-278.



