Stanovení genetického profilu - Holub

Pro ověření příbuznosti objednávejte k testu genetického profilu potomků test: Holub - parentita ke genetickému profilu - pro mláďata

V případě testování genetického profilu preferujeme vzorky krve. Analýza je velice citlivá na kvalitu DNA. Pro analýzu postačuje odběr 2 kapek krve do zkumavky s ethanolem.
Stanovení profilu je možné provést i z krevní skvrny, nebo vytrženého peří (minimálně 7 ks).

Stanovení genetického profilu znamená určit soubor genetických znaků, které jsou pro daného jedince charakteristické a nezaměnitelné (např. jako otisk prstu). Podle genetického profilu lze jedince jednoznačně identifikovat.

Ke stanovení genetického profilu jsou využívány tandemové repetitivní sekvence (STR). Tyto sekvence, také nazývané mikrosatelity, jsou třídou genetických markerů, sestávajících se z tandemově opakovaných sekvencí o velikosti dvou až sedmi párů bází. Alely STR lokusu se mění podle počtu opakování daného sekvenčního motivu. Kvůli vysoké hladině polymorfizmu (informativity) a Mendelovské dědičnosti se mikrosatelity staly vhodnými genetickými markery pro studium diverzity, testování paternity a vlastní identifikace.

STR alely jsou zjišťovány pomocí multiplexové polymerázové řetězové reakce (PCR-polymerase chain reaction). Jeden z primerů každého páru je na 5´ konci označen fluorecenčním barvivem. Fragmenty jsou rozděleny a detekovány v jediném elektroforetickém střiku, s použitím automatizovaného elektroforetického přístroje.

Laboratoř Genomia stanovuje pro DNA profil holuba markery: CliuD11, PIGN15, CliMT43,, PIGN10, CliMD01, PIGN57, CliMT13, PIGN26, CliMD16, CliMD19, PIGN12, CliuMT02, CliMD17, CliMD35, CliMT17, PIGN04

.

Reference:

M. de Groot and W. A. van Haeringen: An evaluation of the International Society for Animal Genetics recommended parentage and identification panel for the domestic pigeon (Columba livia domestica), 2017 VHLGenetics, Agro Business Park 100, NL 6708 PW, Wageningen, The Netherlands