SNP analýza koní pro výzkum genomických šlechtitelských hodnot technologií Illumina Equine80Select BeadChip

BeadChip obsahuje celkem 79 000 markerů, které byly vybrány na základě genotypizace 7 plemen koní (Arabian, Andalusian, Akhal-teke, Islandic, Standardbred, Thoroughbred, Quarter horse):

• přibližně 77 000 autosomálních markerů
• přibližně 2 000 pohlavních markerů
• přibližně 300 mitochondriálních markerů
• přibližně 1 000 markerů pro paternitní určení a stanovení nemocí
• normální hustota markerů v oblastí hlavního histokompatibilního komplexu koní

BeadChip je vhodný pro genetickou imputaci na vyšší hustotu markerů, překryv s markery Axiom Equine Genotyping Array. Vhodné aplikace arraye:

• Komplexních výzkum znaků
  • Analýzy diverzity
  • Genomická predikce rizika onemocnění
  • Ověření původu
• Molekulární šlechtění
  • Základní asociační studie
  • Zvýšení efektivity šlechtitelských programů
  • Základní analýzy signatur selekce