Diverzita plemen psů

Proč nestačí jen zdraví rodičů a proč budoucnost plemen závisí na genetické rozmanitosti

Každé krytí ovlivňuje budoucnost plemene.
Nejen zdraví jednoho vrhu, ale i genetickou stabilitu dalších generací.

.

Úvod: problém, který není na první pohled vidět

Mnoho chovatelů dnes zodpovědně testuje dědičné choroby, sleduje exteriér, pracovní vlohy i povahu. Přesto u řady plemen dlouhodobě přibývá:

• alergií,

• autoimunitních onemocnění,

• problémů s plodností,

• nižší vitality,

• kratší délky života,

• nižší pracovní výkonnosti.

Důvod často neleží v jedné konkrétní nemoci. Problém bývá hlubší → postupná ztráta genetické diverzity plemene. Za posledních několik desetiletí se u mnoha plemen výrazně zúžil genofond. Často neúmyslně:

• nadměrným používáním populárních šampionů,

• selekcí pouze na vzhled,

• vyřazováním příliš velkého množství jedinců z chovu,

• příliš úzkým zaměřením na některé genetické testy,

• opakovaným používáním stejných linií.

Genetická diverzita přitom funguje jako „ochranná síť“ populace. Čím je populace pestřejší, tím lépe zvládá:

• dědičné zátěže,

• multigenní onemocnění,

• změny prostředí,

• dlouhodobé zdravotní problémy.

.

Každý chovatel ovlivňuje budoucnost plemene

Chov není jen rozhodnutí o jednom vrhu.

Každý chovný pes a každá fena ovlivňují:

• budoucí genetickou skladbu plemene,

• množství příbuznosti v populaci,

• budoucí možnosti dalších chovatelů.

Genetika není pouze individuální otázka jednoho psa. Je to kolektivní odpovědnost celé chovatelské komunity.

.

Proč samotné testování nemocí nestačí

Genetické testy jsou mimořádně důležité. Pomáhají:

• předcházet závažným dědičným chorobám,

• identifikovat přenašeče,

• plánovat bezpečná spojení.

Jenže pokud se chov zaměří pouze na „eliminaci všeho rizikového“, může dojít k opačnému problému.

Laický příklad

Představme si plemeno o 1000 psech.

Pokud se rozhodneme vyřadit z chovu všechny přenašeče určité recesivní mutace, může najednou zůstat například jen 300–400 „geneticky čistých“ jedinců.

Výsledek?

• výrazně se zúží genofond,

• začne růst příbuznost,

• poroste riziko jiných problémů,

• diverzita prudce klesne.

Proto moderní genetika doporučuje:

• nevyřazovat automaticky přenašeče,

• používat genetické testy rozumně,

• kombinovat je s hodnocením diverzity populace.

Přenašeč zdravému potomstvu nevadí, pokud je správně spojen s geneticky vhodným partnerem.

.

Co je genetická diverzita

Genetická diverzita znamená, jak geneticky pestrá je populace daného plemene.

Čím větší diverzita:

• tím menší příbuznost,

• tím větší genetická stabilita,

• tím nižší riziko hromadění problémů.

Naopak nízká diverzita znamená, že si psi začínají být geneticky příliš podobní.

.

Proč nestačí sledovat jen COI

Co je COI?

COI (Coefficient of Inbreeding — koeficient příbuzenské plemenitby) udává pravděpodobnost, že potomek zdědí stejné varianty genů od obou rodičů kvůli jejich příbuznosti.

Laicky:

• nízký COI = rodiče nejsou blízce příbuzní,

• vysoký COI = rodiče mají společné předky.

Důležité: nízký COI automaticky neznamená vysokou diverzitu

To je velmi časté nedorozumění.

Dva psi mohou mít:

• nízký COI,

• ale přesto pocházet z geneticky velmi podobné populace.

Rodokmen totiž neukazuje skutečnou genetickou podobnost celé DNA.

Navíc:

• rodokmen bývá omezený počtem generací,

• nezachytí skrytou příbuznost,

• nezohledňuje reálné rozložení genů v populaci.

Proto dnes stále více roste význam genomických metod založených na SNP DNA profilech.

.

Co je SNP DNA profil

SNP profil analyzuje stovky genetických markerů napříč celým genomem psa.

Díky tomu lze mnohem přesněji zjistit:

• genetickou podobnost mezi psy,

• diverzitu populace,

• heterozygotnost,

• skutečné genetické vzdálenosti.

Právě na těchto datech pracuje aplikace:

diverzita2020.genomia.cz

.

Jak funguje PCA diagram

Co je PCA?

PCA (Principal Component Analysis) je matematická metoda, která dokáže převést obrovské množství genetických dat do přehledného grafu.

Laicky řečeno:

• každý pes má stovky genetických informací,

• PCA je „zkomprimuje“ do jednoduché mapy podobnosti.

.

Jak číst PCA diagram

Základní princip

• každý bod představuje jednoho psa,

• body blízko sebe jsou si geneticky podobnější,

• body dál od sebe jsou geneticky odlišnější.

Nejde o „lepší“ nebo „horší“ psy.

Diagram pouze ukazuje:

• jak moc jsou si jedinci geneticky podobní,

• jaká je struktura populace plemene.

.

Proč je PCA užitečné pro chov

PCA umožňuje vidět populaci jako celek.

Chovatel tak může:

• lépe chápat diverzitu plemene,

• vyhledávat méně příbuzné linie,

• nepoužívat stále stejné genetické směry,

• plánovat spojení s větší genetickou rozmanitostí.

.

Jak vybírat vhodný chovný pár

Ideální spojení není:

• jen nejkrásnější pes,

• jen nejúspěšnější výstavní šampion,

• ani pouze geneticky „nejčistší“ jedinec.

Odpovědný výběr kombinuje:

• zdraví,

• povahu,

• exteriér,

• pracovní vlastnosti,

• genetické testy,

• diverzitu populace.

Prakticky v PCA diagramu

Často bývá vhodné:

• nehledat psa úplně „uprostřed stejného shluku“,

• ale ani extrémně vzdáleného jedince bez znalosti linie.

Cílem je:

• rozumně rozšiřovat diverzitu,

• neprohlubovat genetickou uniformitu.

.

Heterozygotnost – proč je důležitá

Co znamená heterozygotnost

Heterozygotnost vyjadřuje, jak pestrou genetickou výbavu pes má.

Vyšší heterozygotnost obecně znamená:

• větší genetickou variabilitu,

• lepší biologickou odolnost,

• menší pravděpodobnost některých problémů spojených s inbreedingem.

Nižší heterozygotnost může souviset s:

• úzkou příbuzností,

• dlouhodobě uzavřeným genofondem,

• opakovaným používáním stejných linií.

.

Co aplikace zobrazuje

Aplikace diverzita2020.genomia.cz Genomia zobrazuje:

• PCA mapu plemene,

• pozici konkrétního jedince,

• heterozygotnost jedince,

• rozložení heterozygotnosti celé populace,

• zobrazena jsou plemena, která mají databázi 30+ DNA profilů.

Chovatel tak může vidět:

• jak si jeho pes stojí v rámci plemene,

• zda pochází z velmi zastoupené linie,

• nebo naopak představuje cenné genetické obohacení.

.

Riziko populárních krycích psů

Jedním z největších problémů moderní plemenitby je nadměrné používání jednoho samce.

I výborný pes může při příliš častém využívání:

• dramaticky snížit diverzitu populace,

• zvýšit příbuznost budoucích generací.

Typický scénář

• objeví se mimořádně úspěšný šampion,

• používá se velmi intenzivně,

• během několika let má obrovské množství potomků,

• v další generaci jsou si psi výrazně příbuznější.

Krátkodobě to nemusí být vidět. Dlouhodobě však diverzita prudce klesá.

.

Importy nejsou automatické řešení

Import zahraničního psa může diverzitu výrazně obohatit.

Jenže pokud:

• se importovaný pes používá příliš často, vznikne velké množství polorodých sourozenců,

• v další generaci začne znovu narůstat příbuznost populace .

Proto je důležité:

• rozumně rozložit využití krycích psů,

• pracovat s větším počtem linií,

• sledovat populaci jako celek.

.

Diverzita a multigenní onemocnění

Mnoho civilizačních onemocnění:

• alergie,

• autoimunitní choroby,

• některé ortopedické problémy,

• poruchy imunity,

není způsobeno jedním genem.

Jde o kombinaci:

• většího množství genů,

• prostředí,

• dlouhodobé ztráty genetické variability.

Právě diverzita pomáhá populaci lépe odolávat těmto komplexním problémům.

.

Málo početná plemena – specifická situace

U malých populací je práce s diverzitou ještě důležitější.

Často zde:

• existuje málo nepříbuzných linií,

• jeden pes může ovlivnit velkou část populace,

• rychle roste příbuznost.

Proto je vhodné:

• sledovat diverzitu celé populace,

• omezovat nadměrné využití jednotlivých psů,

• spolupracovat napříč chovateli,

• využívat genetická data při plánování spojení.

.

Moderní genetika pomáhá dělat lepší rozhodnutí

Dříve měli chovatelé k dispozici hlavně:

• rodokmen,

• zkušenost,

• znalost linií.

Dnes lze díky SNP DNA profilům pracovat mnohem přesněji.

Genetická data umožňují:

• lépe chápat populaci,

• chránit diverzitu,

• plánovat udržitelnější chov.

.

Budoucnost plemen závisí na rozhodnutích dnešních chovatelů

Odpovědný chov není o hledání „dokonalého psa“.

Je o:

• dlouhodobém přemýšlení,

• práci s populací,

• ochraně genetické rozmanitosti,

• rovnováze mezi zdravím, typem a diverzitou.

Každý SNP profil přináší další informace o populaci plemene. A čím více dat bude k dispozici, tím lépe bude možné diverzitu hodnotit a chránit.

.

Poznejte diverzitu svého plemene

Pomocí SNP DNA profilů od společnosti Genomia můžete:

• zobrazit svého psa v PCA diagramu plemene,

• sledovat genetickou podobnost populací,

• hodnotit heterozygotnost,

• pracovat s diverzitou při plánování chovu.